Все источники загрязнений в сельском хозяйстве можно разделить на две группы.
Биотические – в качестве загрязнителя выступают живые организмы. Например, стоки животноводческих комплексов, аммиачный газ.
Абиотические – загрязнителями являются неживые химические и физические компоненты. Например, пестициды, минеральные удобрения.
Пестициды и продукты их распада изначально являются ядом, созданным специально, чтобы убивать насекомых, грибки и бактерии. При этом их систематическое использование, помимо уничтожения вредителей культурных растений, также попутно убивает значительную часть других безвредных организмов — от бактерий и насекомых до животных и птиц, живущих в почве или на грунте. Гибель микрофауны приводит к замедлению естественных процессов разложения органических остатков и превращения их в питательные элементы для растений.
